Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms