Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Fam171bQ14CH0 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
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