Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms