Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms