Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms