Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms