Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Cntnap5cQ0V8T7 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Cntnap5cQ0V8T7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Cntnap5cQ0V8T7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Cntnap5cQ0V8T7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Cntnap5cQ0V8T7 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Cntnap5cQ0V8T7 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Cntnap5cQ0V8T7 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Cntnap5cQ0V8T7 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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