Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92 ms