Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms