Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms