Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms