Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgm3Q08189 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms