Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NrepQ07475 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NrepQ07475 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NrepQ07475 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NrepQ07475 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
NrepQ07475 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
NrepQ07475 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
NrepQ07475 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
NrepQ07475 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms