Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Cdx4Q07424 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Cdx4Q07424 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Cdx4Q07424 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Cdx4Q07424 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Cdx4Q07424 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Cdx4Q07424 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Cdx4Q07424 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Cdx4Q07424 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Cdx4Q07424 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Cdx4Q07424 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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