Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms