Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms