Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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Sh3bp2Q06649 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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Sh3bp2Q06649 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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