Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms