Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms