Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

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Length 594 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RykQ01887 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RykQ01887 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RykQ01887 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RykQ01887 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RykQ01887 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RykQ01887 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RykQ01887 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RykQ01887 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RykQ01887 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RykQ01887 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RykQ01887 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RykQ01887 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RykQ01887 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
RykQ01887 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RykQ01887 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RykQ01887 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RykQ01887 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RykQ01887 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RykQ01887 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RykQ01887 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RykQ01887 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RykQ01887 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RykQ01887 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RykQ01887 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RykQ01887 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RykQ01887 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RykQ01887 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
RykQ01887 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
RykQ01887 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RykQ01887 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
RykQ01887 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RykQ01887 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RykQ01887 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
RykQ01887 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RykQ01887 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RykQ01887 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RykQ01887 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
RykQ01887 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RykQ01887 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RykQ01887 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RykQ01887 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RykQ01887 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RykQ01887 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RykQ01887 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RykQ01887 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RykQ01887 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RykQ01887 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RykQ01887 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RykQ01887 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RykQ01887 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RykQ01887 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RykQ01887 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RykQ01887 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RykQ01887 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RykQ01887 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RykQ01887 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RykQ01887 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
RykQ01887 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RykQ01887 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
RykQ01887 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RykQ01887 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RykQ01887 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RykQ01887 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RykQ01887 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RykQ01887 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RykQ01887 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RykQ01887 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RykQ01887 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
RykQ01887 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
RykQ01887 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RykQ01887 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RykQ01887 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RykQ01887 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RykQ01887 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RykQ01887 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RykQ01887 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RykQ01887 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RykQ01887 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RykQ01887 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RykQ01887 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RykQ01887 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RykQ01887 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
RykQ01887 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
RykQ01887 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RykQ01887 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RykQ01887 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RykQ01887 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RykQ01887 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RykQ01887 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RykQ01887 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RykQ01887 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RykQ01887 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RykQ01887 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RykQ01887 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RykQ01887 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RykQ01887 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RykQ01887 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RykQ01887 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RykQ01887 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms