Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms