Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 178.1 ms