Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SeleQ00690 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SeleQ00690 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SeleQ00690 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SeleQ00690 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SeleQ00690 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SeleQ00690 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SeleQ00690 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SeleQ00690 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms