Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms