Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms