Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bop1P97452 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bop1P97452 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bop1P97452 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bop1P97452 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bop1P97452 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bop1P97452 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Bop1P97452 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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