Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms