Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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