Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Irx2P81066 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Irx2P81066 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irx2P81066 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
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Irx2P81066 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irx2P81066 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irx2P81066 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Irx2P81066 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Irx2P81066 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Irx2P81066 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Irx2P81066 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Irx2P81066 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Irx2P81066 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Irx2P81066 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Irx2P81066 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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