Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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