Protein–RNA interactions for Protein: P70289

Ptprv, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase V, mousemouse

Predictions only

Length 1,705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprvP70289 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprvP70289 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprvP70289 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprvP70289 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprvP70289 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprvP70289 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprvP70289 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprvP70289 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprvP70289 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprvP70289 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprvP70289 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprvP70289 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprvP70289 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprvP70289 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprvP70289 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprvP70289 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprvP70289 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprvP70289 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprvP70289 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprvP70289 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprvP70289 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprvP70289 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprvP70289 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprvP70289 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprvP70289 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprvP70289 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PtprvP70289 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PtprvP70289 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PtprvP70289 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PtprvP70289 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprvP70289 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprvP70289 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprvP70289 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprvP70289 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprvP70289 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprvP70289 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprvP70289 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprvP70289 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprvP70289 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprvP70289 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprvP70289 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprvP70289 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprvP70289 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprvP70289 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprvP70289 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprvP70289 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprvP70289 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprvP70289 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprvP70289 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprvP70289 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprvP70289 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprvP70289 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprvP70289 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprvP70289 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprvP70289 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprvP70289 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprvP70289 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprvP70289 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprvP70289 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprvP70289 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprvP70289 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprvP70289 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprvP70289 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprvP70289 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprvP70289 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprvP70289 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprvP70289 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprvP70289 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprvP70289 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprvP70289 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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PtprvP70289 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprvP70289 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprvP70289 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprvP70289 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprvP70289 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprvP70289 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprvP70289 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprvP70289 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprvP70289 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprvP70289 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprvP70289 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprvP70289 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprvP70289 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprvP70289 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprvP70289 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprvP70289 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprvP70289 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprvP70289 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprvP70289 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprvP70289 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprvP70289 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprvP70289 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprvP70289 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprvP70289 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprvP70289 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprvP70289 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprvP70289 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprvP70289 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprvP70289 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms