Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp7P70280 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp7P70280 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp7P70280 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp7P70280 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp7P70280 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp7P70280 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp7P70280 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp7P70280 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp7P70280 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp7P70280 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp7P70280 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp7P70280 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp7P70280 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp7P70280 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp7P70280 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp7P70280 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp7P70280 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp7P70280 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp7P70280 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp7P70280 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp7P70280 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp7P70280 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp7P70280 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp7P70280 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp7P70280 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp7P70280 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp7P70280 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp7P70280 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp7P70280 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp7P70280 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp7P70280 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp7P70280 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp7P70280 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp7P70280 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp7P70280 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp7P70280 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp7P70280 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp7P70280 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp7P70280 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp7P70280 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp7P70280 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp7P70280 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp7P70280 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp7P70280 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp7P70280 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp7P70280 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp7P70280 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp7P70280 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp7P70280 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp7P70280 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp7P70280 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp7P70280 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp7P70280 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp7P70280 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp7P70280 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp7P70280 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp7P70280 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp7P70280 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp7P70280 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp7P70280 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vamp7P70280 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vamp7P70280 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vamp7P70280 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vamp7P70280 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vamp7P70280 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vamp7P70280 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vamp7P70280 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vamp7P70280 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vamp7P70280 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vamp7P70280 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vamp7P70280 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vamp7P70280 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vamp7P70280 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vamp7P70280 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vamp7P70280 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vamp7P70280 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vamp7P70280 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vamp7P70280 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vamp7P70280 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vamp7P70280 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vamp7P70280 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vamp7P70280 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vamp7P70280 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vamp7P70280 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vamp7P70280 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vamp7P70280 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vamp7P70280 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vamp7P70280 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vamp7P70280 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vamp7P70280 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vamp7P70280 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vamp7P70280 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vamp7P70280 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vamp7P70280 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vamp7P70280 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vamp7P70280 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vamp7P70280 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vamp7P70280 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vamp7P70280 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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