Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NficP70255 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NficP70255 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NficP70255 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NficP70255 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NficP70255 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NficP70255 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NficP70255 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NficP70255 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NficP70255 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NficP70255 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NficP70255 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NficP70255 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NficP70255 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NficP70255 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NficP70255 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NficP70255 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NficP70255 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NficP70255 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NficP70255 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NficP70255 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NficP70255 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NficP70255 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NficP70255 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NficP70255 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NficP70255 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NficP70255 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NficP70255 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NficP70255 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NficP70255 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NficP70255 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NficP70255 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NficP70255 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NficP70255 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NficP70255 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NficP70255 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NficP70255 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NficP70255 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NficP70255 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NficP70255 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NficP70255 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NficP70255 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NficP70255 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NficP70255 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NficP70255 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NficP70255 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NficP70255 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NficP70255 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NficP70255 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NficP70255 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
NficP70255 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
NficP70255 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NficP70255 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NficP70255 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NficP70255 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NficP70255 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NficP70255 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NficP70255 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NficP70255 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NficP70255 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NficP70255 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NficP70255 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NficP70255 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NficP70255 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NficP70255 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NficP70255 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NficP70255 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NficP70255 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NficP70255 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NficP70255 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NficP70255 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NficP70255 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NficP70255 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NficP70255 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NficP70255 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NficP70255 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NficP70255 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NficP70255 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NficP70255 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NficP70255 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NficP70255 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NficP70255 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NficP70255 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NficP70255 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NficP70255 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NficP70255 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NficP70255 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NficP70255 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NficP70255 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NficP70255 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NficP70255 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NficP70255 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NficP70255 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NficP70255 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NficP70255 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NficP70255 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NficP70255 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NficP70255 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NficP70255 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NficP70255 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms