Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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