Protein–RNA interactions for Protein: P63006

Lhx1, LIM/homeobox protein Lhx1, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx1P63006 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lhx1P63006 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lhx1P63006 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lhx1P63006 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lhx1P63006 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lhx1P63006 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lhx1P63006 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lhx1P63006 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lhx1P63006 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lhx1P63006 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lhx1P63006 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lhx1P63006 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lhx1P63006 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lhx1P63006 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lhx1P63006 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Lhx1P63006 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lhx1P63006 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lhx1P63006 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lhx1P63006 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lhx1P63006 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lhx1P63006 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lhx1P63006 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Lhx1P63006 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lhx1P63006 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Lhx1P63006 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lhx1P63006 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lhx1P63006 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lhx1P63006 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lhx1P63006 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lhx1P63006 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lhx1P63006 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lhx1P63006 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lhx1P63006 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lhx1P63006 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lhx1P63006 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lhx1P63006 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lhx1P63006 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lhx1P63006 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lhx1P63006 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lhx1P63006 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx1P63006 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx1P63006 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx1P63006 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx1P63006 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx1P63006 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx1P63006 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx1P63006 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx1P63006 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx1P63006 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx1P63006 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx1P63006 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx1P63006 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx1P63006 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx1P63006 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx1P63006 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx1P63006 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx1P63006 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx1P63006 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx1P63006 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx1P63006 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx1P63006 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx1P63006 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx1P63006 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx1P63006 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx1P63006 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx1P63006 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx1P63006 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx1P63006 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx1P63006 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx1P63006 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx1P63006 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx1P63006 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx1P63006 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx1P63006 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx1P63006 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx1P63006 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx1P63006 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx1P63006 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx1P63006 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx1P63006 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx1P63006 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx1P63006 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx1P63006 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx1P63006 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx1P63006 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx1P63006 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx1P63006 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx1P63006 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx1P63006 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx1P63006 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx1P63006 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx1P63006 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx1P63006 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx1P63006 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx1P63006 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx1P63006 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx1P63006 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx1P63006 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx1P63006 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhx1P63006 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms