Protein–RNA interactions for Protein: P61079

Ube2d3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d3P61079 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d3P61079 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms