Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms