Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms