Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms