Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms