Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NcstnP57716 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NcstnP57716 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NcstnP57716 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NcstnP57716 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NcstnP57716 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcstnP57716 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcstnP57716 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcstnP57716 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NcstnP57716 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcstnP57716 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NcstnP57716 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcstnP57716 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms