Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lim2P56563 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lim2P56563 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lim2P56563 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lim2P56563 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lim2P56563 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lim2P56563 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lim2P56563 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lim2P56563 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lim2P56563 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lim2P56563 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lim2P56563 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lim2P56563 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lim2P56563 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lim2P56563 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lim2P56563 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lim2P56563 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lim2P56563 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lim2P56563 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lim2P56563 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lim2P56563 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lim2P56563 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lim2P56563 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lim2P56563 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lim2P56563 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lim2P56563 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lim2P56563 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lim2P56563 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lim2P56563 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lim2P56563 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lim2P56563 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lim2P56563 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lim2P56563 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lim2P56563 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lim2P56563 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lim2P56563 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lim2P56563 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lim2P56563 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lim2P56563 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lim2P56563 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lim2P56563 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lim2P56563 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lim2P56563 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lim2P56563 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lim2P56563 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lim2P56563 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lim2P56563 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lim2P56563 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lim2P56563 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lim2P56563 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lim2P56563 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lim2P56563 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lim2P56563 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lim2P56563 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lim2P56563 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lim2P56563 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lim2P56563 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lim2P56563 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lim2P56563 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lim2P56563 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lim2P56563 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lim2P56563 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lim2P56563 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lim2P56563 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lim2P56563 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lim2P56563 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lim2P56563 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lim2P56563 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lim2P56563 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lim2P56563 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lim2P56563 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lim2P56563 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lim2P56563 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lim2P56563 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lim2P56563 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lim2P56563 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lim2P56563 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lim2P56563 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lim2P56563 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lim2P56563 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lim2P56563 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lim2P56563 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lim2P56563 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lim2P56563 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lim2P56563 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lim2P56563 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lim2P56563 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lim2P56563 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lim2P56563 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lim2P56563 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lim2P56563 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lim2P56563 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Lim2P56563 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lim2P56563 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lim2P56563 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lim2P56563 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lim2P56563 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lim2P56563 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lim2P56563 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Lim2P56563 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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