Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms