Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Aqp4P55088 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Aqp4P55088 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Aqp4P55088 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Aqp4P55088 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Aqp4P55088 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Aqp4P55088 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Aqp4P55088 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Aqp4P55088 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Aqp4P55088 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Aqp4P55088 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Aqp4P55088 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Aqp4P55088 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Aqp4P55088 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Aqp4P55088 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Aqp4P55088 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Aqp4P55088 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Aqp4P55088 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Aqp4P55088 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Aqp4P55088 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Aqp4P55088 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Aqp4P55088 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Aqp4P55088 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Aqp4P55088 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Aqp4P55088 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Aqp4P55088 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Aqp4P55088 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Aqp4P55088 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Aqp4P55088 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Aqp4P55088 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Aqp4P55088 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Aqp4P55088 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Aqp4P55088 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Aqp4P55088 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Aqp4P55088 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Aqp4P55088 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Aqp4P55088 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Aqp4P55088 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Aqp4P55088 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Aqp4P55088 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Aqp4P55088 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Aqp4P55088 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Aqp4P55088 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Aqp4P55088 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Aqp4P55088 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Aqp4P55088 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Aqp4P55088 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Aqp4P55088 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Aqp4P55088 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Aqp4P55088 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Aqp4P55088 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Aqp4P55088 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Aqp4P55088 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Aqp4P55088 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Aqp4P55088 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Aqp4P55088 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Aqp4P55088 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Aqp4P55088 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Aqp4P55088 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Aqp4P55088 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms