Protein–RNA interactions for Protein: P54729

Nub1, NEDD8 ultimate buster 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nub1P54729 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nub1P54729 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nub1P54729 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nub1P54729 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nub1P54729 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nub1P54729 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nub1P54729 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nub1P54729 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nub1P54729 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nub1P54729 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nub1P54729 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nub1P54729 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nub1P54729 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nub1P54729 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nub1P54729 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nub1P54729 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Nub1P54729 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nub1P54729 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nub1P54729 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nub1P54729 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nub1P54729 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nub1P54729 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nub1P54729 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nub1P54729 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nub1P54729 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nub1P54729 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nub1P54729 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nub1P54729 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Nub1P54729 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Nub1P54729 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Nub1P54729 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nub1P54729 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Nub1P54729 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Nub1P54729 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Nub1P54729 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Nub1P54729 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Nub1P54729 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nub1P54729 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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