Protein–RNA interactions for Protein: P50636

Rnf19a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF19A, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf19aP50636 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf19aP50636 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms