Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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BckdhaP50136 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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BckdhaP50136 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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BckdhaP50136 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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BckdhaP50136 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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BckdhaP50136 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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BckdhaP50136 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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BckdhaP50136 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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BckdhaP50136 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
BckdhaP50136 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
BckdhaP50136 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
BckdhaP50136 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
BckdhaP50136 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
BckdhaP50136 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
BckdhaP50136 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
BckdhaP50136 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
BckdhaP50136 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
BckdhaP50136 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
BckdhaP50136 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
BckdhaP50136 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
BckdhaP50136 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BckdhaP50136 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BckdhaP50136 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BckdhaP50136 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BckdhaP50136 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
BckdhaP50136 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BckdhaP50136 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
BckdhaP50136 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
BckdhaP50136 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
BckdhaP50136 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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