Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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