Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp3P49194 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp3P49194 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp3P49194 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp3P49194 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp3P49194 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp3P49194 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp3P49194 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp3P49194 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp3P49194 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp3P49194 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp3P49194 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp3P49194 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp3P49194 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp3P49194 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp3P49194 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp3P49194 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp3P49194 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp3P49194 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp3P49194 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp3P49194 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp3P49194 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp3P49194 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp3P49194 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp3P49194 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp3P49194 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp3P49194 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp3P49194 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp3P49194 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp3P49194 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp3P49194 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp3P49194 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp3P49194 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp3P49194 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp3P49194 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp3P49194 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp3P49194 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp3P49194 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp3P49194 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp3P49194 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp3P49194 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp3P49194 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp3P49194 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp3P49194 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp3P49194 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms