Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
VdrP48281 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
VdrP48281 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VdrP48281 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VdrP48281 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
VdrP48281 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
VdrP48281 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
VdrP48281 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
VdrP48281 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
VdrP48281 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
VdrP48281 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VdrP48281 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VdrP48281 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VdrP48281 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VdrP48281 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
VdrP48281 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
VdrP48281 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VdrP48281 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VdrP48281 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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VdrP48281 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VdrP48281 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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VdrP48281 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VdrP48281 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VdrP48281 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VdrP48281 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VdrP48281 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VdrP48281 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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VdrP48281 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VdrP48281 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VdrP48281 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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VdrP48281 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VdrP48281 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VdrP48281 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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VdrP48281 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
VdrP48281 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
VdrP48281 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
VdrP48281 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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VdrP48281 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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VdrP48281 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VdrP48281 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VdrP48281 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VdrP48281 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VdrP48281 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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VdrP48281 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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VdrP48281 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VdrP48281 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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VdrP48281 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VdrP48281 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VdrP48281 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VdrP48281 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VdrP48281 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VdrP48281 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VdrP48281 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VdrP48281 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VdrP48281 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VdrP48281 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VdrP48281 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VdrP48281 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VdrP48281 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VdrP48281 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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